BLAST Resut
BLASTP 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for compositional score matrix adjustment: Altschul, Stephen F.,
John C. Wootton, E. Michael Gertz, Richa Agarwala, Aleksandr Morgulis,
Alejandro A. Schaffer, and Yi-Kuo Yu (2005) "Protein database searches
using compositionally adjusted substitution matrices", FEBS J. 272:5101-5109.
Query= Eca_sc000113.1_g0150.1
(487 letters)
Database: Araport11_genes.201606.pep
48,359 sequences; 20,855,782 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
AT1G21310.1 | extensin 3 | Chr1:7453693-7454988 REVERSE LENGTH=4... 64 1e-10
>AT1G21310.1 | extensin 3 | Chr1:7453693-7454988 REVERSE LENGTH=431
| 201606
Length = 431
Score = 63.5 bits (153), Expect = 1e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 187/471 (39%), Positives = 210/471 (44%), Gaps = 87/471 (18%)
Query: 1 MARLMPCLVRALAICLVATVVLADDPYTYSETPKKPVLDVEATLHTDAYSSPPPPAYHYT 60
M M LV L + ++ ++ Y YSSPPPP HYT
Sbjct: 1 MGSPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANY------------------FYSSPPPPVKHYT 42
Query: 61 SPPPPPKYTPSGQEHKPLPAPAKSHHYASYDYKSPPPPPAYY-----------------Y 103
PP Y+P P P K H Y+YKSPPPP +Y Y
Sbjct: 43 --PPVKHYSPPPVY--HSPPPPKKH----YEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVY 94
Query: 104 KSPPPPSPVIAP------------KYVYSSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPP 149
KSPPPP +P YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPP
Sbjct: 95 KSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPP 154
Query: 150 PPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPAY 205
PP +Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP
Sbjct: 155 PPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVK 214
Query: 206 YYKSPPPPSPMVAPK--YVYNSPPPPAYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPSPYYYKS 261
+Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPP +Y
Sbjct: 215 HYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSP 274
Query: 262 PPPPSPIVAPK--YVYSSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPPPTYYYKSPPPPAY 319
PP PK YVY SPPPP +Y PP PK Y YKSPPPP
Sbjct: 275 PPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK--------KHYVYKSPPPPVK 326
Query: 320 YYKSPPPPSPVVAPK--YVYSSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPTYYYK- 374
+Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y
Sbjct: 327 HYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSP 386
Query: 375 -SPPPPSPVVAPKYVYNSPPPPKYYYKSPPPPSPVVEPKYIYNSPPPPTYY 424
P KYVY SPPPP ++ SPP Y+Y SPPPP +Y
Sbjct: 387 PPVYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHYSPP------HHPYLYKSPPPPYHY 431
Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 177/404 (43%), Positives = 195/404 (48%), Gaps = 52/404 (12%)
Query: 88 ASYDYKSPPPPPAYYYKSPP----------PPSPVIAPKYVYSSPPPPTYYYKSPPPPSP 137
A+Y Y SPPPP +Y +PP P Y Y SPPPP +Y PP
Sbjct: 27 ANYFYSSPPPPVKHY--TPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHS 84
Query: 138 VVAPK--YVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAP 193
PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y PP P
Sbjct: 85 PPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPP 144
Query: 194 K--YVYNSPPPPAYYYKSPPPPSPMVAPK--YVYNSPPPPAYYYKSPPPPSPVVAPK--Y 247
K YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK Y
Sbjct: 145 KKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHY 204
Query: 248 VYNSPPPSPYYYKSPPPPSPIVAPK--YVYSSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNS 303
VY SPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY S
Sbjct: 205 VYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKS 264
Query: 304 PPPPT------------------YYYKSPPPPAYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYSSPPPP 343
PPPP Y YKSPPPP +Y PP PK YVY SPPPP
Sbjct: 265 PPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPP 324
Query: 344 TYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPKYYY 399
+Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y
Sbjct: 325 VKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY 384
Query: 400 K--SPPPPSPVVEPKYIYNSPPPPTYYYKSPPPPAYYYKSPPPP 441
P + KY+Y SPPPP ++ SPP Y YKSPPPP
Sbjct: 385 SPPPVYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHYSPPHHPYLYKSPPPP 428
Score = 49.3 bits (116), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 170/425 (40%), Positives = 190/425 (44%), Gaps = 82/425 (19%)
Query: 138 VVAPKYVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAP-------------------KYVYNSPPPPT 178
V+ + S Y+Y SPPPP P Y Y SPPPP
Sbjct: 14 VLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPV 73
Query: 179 YYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPAYYYKSPPPPSPMVAPK--YVYNSPPPPAYYYK 234
+Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y
Sbjct: 74 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYS 133
Query: 235 SPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPSPYYYKSPPPPSPIVAPK--YVYSSPPPPTYYYKSPPP 290
PP PK YVY SPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y PP
Sbjct: 134 PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPV 193
Query: 291 PSPVVAPK--YVYNSPPPPT------------------YYYKSPPPPAYYYKSPPPPSPV 330
PK YVY SPPPP Y YKSPPPP +Y PP
Sbjct: 194 YHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSP 253
Query: 331 VAPK--YVYSSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK--YVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPK 386
PK YVY SPPPP +Y PP PK YVY SPPPP +Y PP PK
Sbjct: 254 PPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPK 313
Query: 387 --YVYNSPPPPKYYYKSPPPPSPVVEPK--YIYNSPPPPTYYYKSPPPP--------AYY 434
YVY SPPPP +Y PP PK Y+Y SPPPP +Y PP Y
Sbjct: 314 KHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 373
Query: 435 YKSPPPPSPIVA------------SKYEYSSPPPPSPYYYNSPPPPSPAVAPKYVYNSPP 482
YKSPPPP + KY Y SPPPP ++Y+ P P Y+Y SPP
Sbjct: 374 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHHYSPPHHP-------YLYKSPP 426
Query: 483 PPTYY 487
PP +Y
Sbjct: 427 PPYHY 431