BLAST Resut
BLASTP 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for compositional score matrix adjustment: Altschul, Stephen F.,
John C. Wootton, E. Michael Gertz, Richa Agarwala, Aleksandr Morgulis,
Alejandro A. Schaffer, and Yi-Kuo Yu (2005) "Protein database searches
using compositionally adjusted substitution matrices", FEBS J. 272:5101-5109.
Query= Eca_sc000113.1_g0140.1
(339 letters)
Database: ./nr
95,329,361 sequences; 35,143,497,570 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
XP_016713984.1 PREDICTED: extensin-like isoform X1 [Gossypium hi... 99 2e-19
>XP_016713984.1 PREDICTED: extensin-like isoform X1 [Gossypium hirsutum]
XP_016713985.1 PREDICTED: extensin-like isoform X2
[Gossypium hirsutum]
Length = 465
Score = 98.6 bits (244), Expect = 2e-19, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 104/174 (59%), Positives = 104/174 (59%), Gaps = 33/174 (18%)
Query: 118 YVYNSPPPP--TYYYKSPPPPTYYYKSPPPPSPVIA------------PKYVYNSPPPPT 163
YVY SPPPP TY YKSPPPP YYYKSPPPP V P YVY SPPPP
Sbjct: 69 YVYKSPPPPSPTYVYKSPPPPAYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPV 128
Query: 164 YYYKSPPPPSPVVA------------PKYVYNS-PPPAYYYKSPPPPSPVVA--PKYVYN 208
YYYKSPPPP V P YVY S PPP YYYKSPPPP V Y
Sbjct: 129 YYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSP 188
Query: 209 SPPPPAYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPPPTYYYKSPPPPAYYYKSPPPPSPV 262
PP P Y YKSPPPPSP YVY SPPPP YYYKSPPPP Y YKSPPPP V
Sbjct: 189 PPPAPTYVYKSPPPPSPT----YVYKSPPPPVYYYKSPPPPTYVYKSPPPPKHV 238
Score = 85.9 bits (211), Expect = 4e-15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 106/169 (62%), Positives = 109/169 (64%), Gaps = 28/169 (16%)
Query: 90 SYDYKSPPPPPAYYYNSPPPPSPVVAPKYVYNSPPPP--TYYYKSPPPPTYYYKSPPPPS 147
+Y YKSPPPP AYYY SPPPP V P Y Y SPPPP TY YKSPPPP YYYKSPPPP
Sbjct: 80 TYVYKSPPPP-AYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPK 138
Query: 148 PVIAP------------KYVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPP---AYYYK 192
V P YVY SPPPP YYYKSPPPP V P Y Y SPPP Y YK
Sbjct: 139 HVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYK 198
Query: 193 SPPPPSPVVAPKYVYNSPPPPAYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPPPTY 241
SPPPPSP YVY SPPPP YYYKSPPPP+ YVY SPPPP +
Sbjct: 199 SPPPPSPT----YVYKSPPPPVYYYKSPPPPT------YVYKSPPPPKH 237
Score = 84.3 bits (207), Expect = 1e-14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 108/186 (58%), Positives = 110/186 (59%), Gaps = 44/186 (23%)
Query: 163 TYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPP-AYYYKSPPPPSPVVAP------------KYVYNS 209
TY YKSPPPPSP YVY SPPP AYYYKSPPPP V P YVY S
Sbjct: 68 TYVYKSPPPPSPT----YVYKSPPPPAYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKS 123
Query: 210 PPPPAYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPPP--TYYYKSPPPPAYYYKSPPPPSPVVVP-- 265
PPPP YYYKSPPPP V P Y Y SPPPP TY YKSPPPP YYYKSPPPP V P
Sbjct: 124 PPPPVYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPKHVEQPPY 183
Query: 266 ----------KYVYNSPPPPTYYSPPPPTYYYKSPPPPSPIVAPKYEYNSPPPPSPYYYN 315
YVY SPPPP+ PTY YKSPPPP Y Y SPPPP+ Y Y
Sbjct: 184 YYKSPPPPAPTYVYKSPPPPS------PTYVYKSPPPPV------YYYKSPPPPT-YVYK 230
Query: 316 SPPPPS 321
SPPPP
Sbjct: 231 SPPPPK 236
Score = 71.6 bits (174), Expect = 3e-10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 89/178 (50%), Positives = 92/178 (51%), Gaps = 47/178 (26%)
Query: 46 TDAYSSPPPP-PAYHYTSPPPPPKYT-----PSGQEHKPLPAPAKSHHYASYDYKSPPPP 99
T Y SPPPP P Y Y SPPPP Y P E P + +Y YKS PPP
Sbjct: 68 TYVYKSPPPPSPTYVYKSPPPPAYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKS-PPP 126
Query: 100 PAYYYNSPPPPSPVVA------------PKYVYNSPPPPTYYYKSPPPP----------- 136
P YYY SPPPP V P YVY SPPPP YYYKSPPPP
Sbjct: 127 PVYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPKHVEQPPYYYK 186
Query: 137 -------TYYYKSPPPPSPVIAPKYVYNSPPPPTYYYKSPPPPSPVVAPKYVYNSPPP 187
TY YKSPPPPSP YVY SPPPP YYYKSPPPP+ YVY SPPP
Sbjct: 187 SPPPPAPTYVYKSPPPPSPT----YVYKSPPPPVYYYKSPPPPT------YVYKSPPP 234
Score = 62.0 bits (149), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 102/230 (44%), Positives = 105/230 (45%), Gaps = 87/230 (37%)
Query: 181 VYNSPPPAYYYKSP--------------------------------------PPPSPVVA 202
V + P Y K P PPPSP
Sbjct: 23 VLRAKPFGYGSKKPYKKCEKYTPKPPTHPYKPPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPSPT-- 80
Query: 203 PKYVYNSPPPPAYYYKSPPPPSPVVA--PKYVYNSPPPPTYYYKSPPPPAYYYKSPPPPS 260
YVY SPPPPAYYYKSPPPP V Y PP PTY YKSPPPP YYYKSPPPP
Sbjct: 81 --YVYKSPPPPAYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPK 138
Query: 261 PVVV------------PKYVYNSPPPPTYY--SPPPP------------------TYYYK 288
V P YVY SPPPP YY SPPPP TY YK
Sbjct: 139 HVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYK 198
Query: 289 SPPPPSPIVAPKYEYNSPPPPSPYYYNSPPPPSPAVAPKYVYNSPPPPAY 338
SPPPPSP Y Y SPPPP YYY SPPPP+ YVY SPPPP +
Sbjct: 199 SPPPPSPT----YVYKSPPPPV-YYYKSPPPPT------YVYKSPPPPKH 237
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 65/126 (51%), Positives = 70/126 (55%), Gaps = 26/126 (20%)
Query: 53 PPPPAYHYTSPPPPPKYTPSGQEHKPLPAPAKSHHYASYDYKSPPPPPAYYYNSPPPPSP 112
PPPP Y+Y SPPPP E P + +Y YKSPPPP YYY SPPPP
Sbjct: 124 PPPPVYYYKSPPPP-----KHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPP-VYYYKSPPPPKH 177
Query: 113 VVAP------------KYVYNSPPPP--TYYYKSPPPPTYYYKSPPPPSPVIAPKYVYNS 158
V P YVY SPPPP TY YKSPPPP YYYKSPPPP+ YVY S
Sbjct: 178 VEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPSPTYVYKSPPPPVYYYKSPPPPT------YVYKS 231
Query: 159 PPPPTY 164
PPPP +
Sbjct: 232 PPPPKH 237
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 78/151 (51%), Positives = 80/151 (52%), Gaps = 43/151 (28%)
Query: 231 YVYNSPPPP--TYYYKSPPPPAYYYKSPPPPSPVVVPKYVYNSPPPP----TYYSPPPPT 284
YVY SPPPP TY YKSPPPPAYYYKSPPPP V P Y Y SPPPP Y SPPPP
Sbjct: 69 YVYKSPPPPSPTYVYKSPPPPAYYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPV 128
Query: 285 YYYKSPPPPSPIVAP------------KYEYNSPPPPSPYYYNSPPPPSPAV-------- 324
YYYKSPPPP + P Y Y SPPPP YYY SPPPP
Sbjct: 129 YYYKSPPPPKHVEQPPYYYKSPPPPAPTYVYKSPPPPV-YYYKSPPPPKHVEQPPYYYKS 187
Query: 325 ----------------APKYVYNSPPPPAYY 339
+P YVY SPPPP YY
Sbjct: 188 PPPPAPTYVYKSPPPPSPTYVYKSPPPPVYY 218